Debian GNU/Linux sid前提で話をします。
NTPとは簡単に言うと時刻合せのためのprotocolで、公開NTPサーバがあったりしてそこにNTPクライアントがアクセスすると自動でPCの時刻を調整してくれたりします。
ただ、全PC（例えば日本中のPC）が公開NTPサーバにアクセスすると相当の負荷となります。ですから企業や家庭でも複数台のPCがある場合、LAN内にNTPサーバを設置するわけです。
そうすることによって公開NTPサーバの負荷軽減に繋がると言うことです。
その手順は、
まずapt-get install ntp-simple ntpdateを実行
rootでvi /etc/ntp.confで設定ファイルを開く
以下の行を追加する。
server ntp1.jst.mfeed.ad.jp
server ntp2.jst.mfeed.ad.jp
server ntp3.jst.mfeed.ad.jp
server clock.nc.fukuoka-u.ac.jp
server clock.tl.fukuoka-u.ac.jp
セーブして閉じたら以下を実行
# /etc/init.d/ntp-simple stop
# ntpdate <適当なNTPサーバ>
# /etc/init.d/ntp-simple start
以上です。
そうしたらLAN内のPCからはこのNTPサーバに繋ぐように設定を変えればOK
（NTPサーバと同期するのにしばらく時間がかかりますが問題はないと思います。）